港澳通行证背面的签注有效期的作用如下：
1、签注有效期之内，都可以凭这个签注入境。
2、港澳通行证证件本有效期5年。
3、港澳通行证签注有效期分3个月和1年，从签发日期起开始起算。
港澳通行证，俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。
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