为了进一步方便长株潭城际铁路沿线的旅客进站乘车，中国铁路广州局集团有限公司湖南城际铁路公司，根据城际铁路公交化运营的特点，联合中铁银通支付公司和中国银行等单位，开发了"铁路e卡通"项目。
铁路e卡通是出行不买票直接刷卡乘车的便捷方式，"铁路e卡通"投入使用后，实现了旅客乘降"验检合一"，简化了进出站流程。使用"铁路e卡通"无需预先购票。
2018年10月30日，“铁路e卡通”在长株潭城际铁路正式上线投入使用。长株潭城际铁路成为全国铁路首条可通过手机扫码进站乘车的线路，旅客只需在12306手机客户端进行简单操作，便可在长株潭城际铁路沿线各站，通过手机扫码进站乘车