创建于，时称“华东军区人民医学院”。1950年改称上海军医大学。1951年7月正式定名为第二军医大学。目前，学校是国家“”、军队“”和总后“”重点建设院校，军队研究生培养重点建设院校、国家生命科学与技术人才培养基地、外军医学留学生培养基地。校机关设“”，下辖“”、3个师级学员管理单位、3所附属医院、1个国家肝癌科学中心和5个干休所，现已成为我军面向东南沿海的重要卫勤力量。
如果是高考统招入学的，毕业后在全军范围内分配，，裸眼4.6以上。按照所学专业分配，。如若不入军籍，但享受军校学员待遇，五年后再入军籍。毕业后必须服从分配，否则有很重的经济赔偿，自费生不享受军校学员待遇，只有自己找工作。