鹌鹑鉴别公母一般建议在鹌鹑出壳后24小时内进行，主要方法是通过翻肛观察鹌鹑的泄殖腔粘膜下是否存在生殖器特征。在破壳超过24小时后，泄殖腔内的生殖器特征一般就不那么明显了。
鹌鹑可以根据身体特征区分公母，一般公鹌鹑的体型比较紧凑，平均体重小于母鹌鹑，母鹌鹑的体型比较宽大，平均体重也大。
鹌鹑可以根据鸣叫声区分公母，公鹌鹑的鸣叫声一般短促而高朗，母鹌鹑的叫声则比较细小低微。