使用柠檬酸去除水垢时的注意事项一般有包括但不限于：一、柠檬酸除垢无法清除因为高热而产生的焦痕。二、柠檬酸是一种高浓度食品添加剂，不可直接食用。三、为防止儿童误食，建议放在儿童触碰不到的地方，同时在用于除垢时，让儿童远离除垢区域。
柠檬酸在经过适度加热后，会变成无水化合物，可以一定程度上增强溶解污垢的能力，加快去除水垢的进度。
柠檬酸除垢主要是利用生物酸溶解碳酸盐的特性，来达到快速分解水垢的目的，同时柠檬酸还有着一定程度的杀菌效果。