佣金和手续费都是办理某些事项是产生的费用，但是在性质和收取方式等方面是不同的。
1、费用缴纳不同。
佣金是在提供代理服务后产生的费用；而手续费是在提供服务前就需要缴纳的费用。
2、收取方式不同。
佣金通常是根据双方约定的金额来收取的；而手续费通常是固定的，根据服务项目不同，所收取的费用也不同。
3、费用性质不同。
佣金收入就是商业活动中的一种劳务报酬，是具有独立地位和经营资格的中间人在商业活动中为他人提供服务所得到的报酬；而手续费可以为行政收费，即在完成行政事项前所需缴纳的费用。
手续费在银行系统分为两种
一、除贷款以外的利息统称为手续费。如：信用卡分期还款产生的利息，信用卡逾期产生的利息；
二、在银行办理业务时产生的工本费。
佣金符合三个条件：
1、有合法真实凭证；
2、支付的对象必须是独立的有权从事中介服务的纳税人或个人；
3、支付给个人的佣金，除另有规定者外不得超过服务金额的5%，可以计入销售费用。