2022年，第二轮双一流建设高校名单公布，重庆有2所大学入选，但是没有陆军军医大学，所以陆军军医大学不是双一流大学。
大学机关编设一办七处;（办公室、教务处、教保处、科研学术处、政治工作处、纪检监察处、安全管理处、供应保障处）和职业教育中心、教学考评中心、教研保障中心、服务保障中心、警通勤务连，下设基础医学院、军事预防医学系、药学与检验医学系、生物医学工程与影像医学系、高原军事医学系、全科医学系、医学心理系、护理系、陆军卫勤训练基地、研究生院、外训大队、士官学校（含附属医院）、边防卫勤训练大队，以及西南医院（含陆军第九五八医院）、新桥医院（含陆军第九五三医院）两所附属医院和陆军特色医学中心。