社保补扣，就是以前应该扣的，但是没扣，重新扣回来。发生补扣一般情况会在每年的年中，因为年中时上一年的社平工资就出来了，社保的缴费基数是根据上一年度的社平工资制定睥，这样就需要把本年至社平工资出来时期间月份的应扣未扣款进行补扣。
例如：2010年的社平工资现在还没出来，假如5月份出来变成5000的话，那社保四险的最低缴费基数就是5000的40%，即2000元。这样1-4月份所有最低缴费基数低于2000元的在职员工的保险就会被补扣，按2000元的最低基数-1-4个月实际的基数再乘以相应的比例进行补扣。