第一，公务舱和头等舱的座位不同：公务舱，一般是两人一排，介于头等舱和经济舱之间。而头等舱一般设在客舱的前部，座椅的尺寸和前后间距都比较大，长航线甚至会采用平躺式座椅。
第二，公务舱和头等舱享受的服务不同：一般来说，头等舱每位乘务员只照顾几名乘客，而公务舱每位乘务员要照顾十几名乘客。
第三，公务舱和头等舱的价格不同：一般国内头等舱、公务舱的价格分别为经济舱的1.5、1.3倍。
第四，两者候机方式不同：持有公务舱机票的旅客可以免费使用机场侯机室。而头等舱旅客可享受VIP专贵服务，有私密的房间。
第五，两者登机方式不同：头等舱是直送飞机，而商务舱是和经济舱在一个地方登机。